Probier's halt mal bei anderen Spielen.
Wenn dort die Spielstände auch nicht geladen werden können, ist wahrscheinlich die MMC einfach fehlerhaft. Kann bei nicht-Nintendo-Cards schon mal leicht vorkommen (wenn du so eine hast, wenn nicht, beschwer' dich bei Nintendo).

Ansonsten muss es wohl an den Speicherdatein von FFCC liegen, vielleicht hast du mal den Cube zu früh abgedreht/die MMC zu früh herausgezogen?

Ansonsten hab ich auch keine Ahnung, ich wüsste auch nicht, woran es sonst liegen könnte...