Klingt nach ner physischen Ursache, vermutlich steifer Nacken. Achte mal auf deine Körperhaltung beim Sitzen in der Schule, vor allem während des Schreibens und versuch dich in den Pausen so viel wie möglich zu bewegen. Wenn du jemanden hast, der das machen würde, dann lass dir abends Nacken- und Schulterbereich mit leichten Druck- und Kreisbewegungen von Innen nach Außen massieren, kannst aber auch alleine machen mit sonnem Stachelball oder bloßen Händen (solltest du es allein versuchen: immer nur eine Schulter massieren, sonst wird's schlimmer als vorher, der Nacken ist sowieso viel wichtiger).

Könnt auch an den Füßen liegen; man glaubt es kaum, aber ein Senkfuß führt häufiger zu Kopfschmerzen in dem Bereich. Da ihr aber sicherlich auch solche ekligen uniformen Holzstühle habt, die in etwa so rückenschonend sind wie eine Nacht auf nem Hartplatz zu schlafen, halte ich Probleme mit Rücken-Schultern-Nacken für wahrscheinlicher.