Wenn du den Maker neu installiert hast, kann's nur an der Midi selbst oder an deinem PC liegen...oder in der Registry sind noch fehlerhaften Daten vorhanden.
Probier mal, die Midi ausserhalb des Makers anzuhören, falls sie da auch verzerrt klingt, ist entweder die Midi oder der PC kaputt (ich würde dann eher ersteres vermuten).
Falls nicht, deinstalliere den Maker, geh unter Start - Ausführen - regedit (eingeben) - HKEY_LOCAL_MACHINE - SOFTWARE - RPG-Maker 2000 und lösche dort alle Daten.
Dann neu installieren und es müsste gehen. Wenn nicht, weis ich auch nicht weiter.