Die Windows sollten am Ende von Window_Base abstammen, weshalb es reichen sollte, in Window_Base die Transparenz zu entfernen.
Du kannst die Zeile einfach in die initialize Methode packen:
oder über main ein neues Script einfügen (falls du dort noch keines hast, was bereits diese Methode anpackt, sonst kannst du dieses einfach direkt erweitern):