Du hast entweder eine sehr kleine oder eine sehr schnelle Festplatte, oder du kannst damit leben, dass deine Festplatte bei Laufzeit nichts weiter macht, als Sicherungspkopien von sich selbst zu erstellen.
Genügt's dir nicht, wenn bestimmte Ordner bei Änderung von Inhalten gesynct werden? Dann sind Kollegen wie Dropbox, Onedrive, S3 oder Google Drive deine Freunde! Dein Use Case macht aus meiner Sicht wenig Sinn - wie du schon selbst schreibst brauchst du ja nicht sämtliche Software zu sichern.