Du kannst die Figuren schräg laufen lassen, indem du beispielsweise mittels der Passworteingabe einen Übersetzer baust, der "Pfeiltaste links" in den Bewegungsbefehl "Move left down" überträgt.
Nur Achtung: Du kehrtest dann zwar vom 90°-Bewegungswinkel ab, aber der neue wäre nicht der handelsüblich isometrische (der liegt bei einer um ~30° gedrehten Darstellung). Deine Figuren liefen nun in 45°-Winkeln, was einen zur normalen Videospielisometrie beträchtlichen Winkelunterschied von 15° ausmachte und dir die Suche nach geeigneten Spielgrafiken erschwerte. Die 30°-Bewegung in den 2003er Maker einzubauen, kann ich mir nur als ungemein würgig vorstellen und breche diesen Gedankengang sicherheitshalber ab.