Man kann auch weiterhin kleinere und größere Charsets benutzen, solange die sich von der Aufteilung her an die Vorgaben halten (3x4 Frames pro Character und das ggf. in Sets zu mehreren angeordnet).
Problem ist eher, dass sich der MV standardmäßig nach seinem 48x48px Raster richtet, was man in jedem Fall im Editor in Betracht ziehen muss.

MfG Sorata