Ich für meinen Teil hatte damals unter Win9x kein Glück; die konnten keine .bat-Dateien ausführen, sondern wirklich nur solche, die "selbstständig" lauffähig waren (damals hatte ich einen bat2com-Konverter, mit dem das hinhaute... Aber das kann man spätestens mit 64bit-Systemen vergessen...)
Was auf alle Fälle funktioniert: Mit irgendeiner Programmiersprache ein Programm schreiben & kompilieren, was das andere Programm in C: aufruft. Ist natürlich eine "von Hinten durch die Brust ins Auge"-Lösung, aber was anderes fällt mir ehrlichgesagt auch nicht ein^^...