Enterbrain hat es an dieser Stelle richtig gemacht.
Die verschiedenen Viewports trennen gewisse "Arten" von Grafiken.
Pictures und Battle-Animations sollen in einer gewissen Ordnung vorliegen, die gewählte Ordnung ist, dass Pictures immer über den Battle-Animations sind.
Das kann man als vorteilhaft oder nicht ansehen, aber es ist auf jedenfall konsequent.

In diesem Fall machst du es auf eine Quick-&-Dirty Variante die zu dem Problem führt. Du versuchst Pictures für Charaktere zu missbrauchen, und dafür sind sie nicht gedacht.
Die "ordentlich" Lösung wäre es die Battle-Sprites selbst zu schreiben und die Spriteset_Battle-Klasse abzuändern.