Ich hab die Erfahrung gemacht, dass es oft besser ist, die interne GamePad-Steuerung zu deaktivieren und ganz auf XPadder umzusteigen. XPadder erlaubt meist einen viel höheren Detailgrad an Einstellungen als die interne Lösung, nicht zu vergessen das Einrichten von Combobefehlen, was oft sehr nützlich sein kann.
Ich kenne XPadder in Mass Effect nicht, aber wenn das Programm nicht tut, was es eigentlich sollte, dann liegt das oft daran, dass das Spiel selber etwas dazwischen funkt. Ansonsten ist es ja nur eine 1:1 Abbildung der anderen Eingabegeräte auf das Gamepad.