Ich kann es verständlicherweise nicht ausprobieren, aber zuallererst würde ich dir raten zu versuchen "$game_message.clear" in deinem Event als Script aufzurufen.

Falls das noch nicht das gewünschte Ergebnis liefert musst du, wie in meinem letzten Code-Beispiel, eine neue Funktion in der "Scene_Map" erstellen und etwas in der Richtung ausprobieren:
Code: 
def end_message_instantly
  $game_message.clear
  @window_message.clear_instance_variables
  @window_message.close_and_wait
end
Oder ähnliches. (Ich weis nicht genau wie das Message_Window in der Szene genannt wird.)
Falls dies zu einem Fehler führt dann melde dich bitte nocheinmal und zeig uns den Fehlertext.