Zum einen wurde das Spiel nicht von Square Enix internen Teams erstellt. Da war höchstens ein Producer und QA Leute von SE dabei.
Zum anderen steckt da mehr als Programmierarbeit dahinter. Denkst du die ganzen Texturen, Modelle, Levels, Animationen etc. haben die aus der NES Version benutzt? XD
Ganz davon abgesehen wurden einige Stellen des Spiels verändert, erweitert und komplett rebalanced.
Und ich finde sowieso FF3 ist ein schlechtes Beispiel, da es vor der DS Version nie ein Remake gab und es auch sonst im Westen nicht erschienen ist.