Huch, okay verwirrend.
Sag doch gleich, dass es sich um zwei gänzlich verschiedene Mods handelt. In dem Fall wird Elsweyr 3.1 nicht mit "Elsweyr - The Deserts of Anequina" kompatibel sein, da sie beide die selbe Region bearbeiten. Bei solch großen Projekten ist Kompatibilität eine Heidenarbeit, dass heißt wenn sie es kompatibel gemacht hätten, würde davon garantiert was in der Readme stehen (außer dem gäbe es Patch-Plugins).

Zu deiner Frage mit den Teilen 1, 2 und 3: Ich weiß nicht, was das für Teile sind, von denen du sprichst, aber wenn es eine neuere Version gibt, dann wird diese höchstwahrscheinlich deine drei Teile da nicht benötigen. Die sind immerhin schon 1 Jahr alt.

Mein Tipp wäre also, die drei Teile zu deinstallieren und dich dann für eine Mod zu entscheiden: entweder "Elsweyr Confederacy Project" oder "Elsweyr - The Deserts of Anequina".