hab einfach von oben nach unten alle Steine entfernt. Schicht für Schicht.
hab aber vorerst die Außenwände gelassen, die im Wasser lagen. Dann habe ich eine Schicht 1 Meter unter dem Wasser aufgebaut, damit man auf dieser Schicht das Wasser ruhig bekommt.
Im MMXCraft Forum gibt es ja eine Beschreibung, wie man ruhiges Wasser "produziert". Danach die Zwischendecke und die Außenwände entfernt.

Alles in einem, hab ich da ca. ne Stunde dran gesessen.

Du hattest doch genug Eimer. Warum hast du die Lava nicht mit dem Eimer wieder eingesammelt?