Damit ihr euch nicht nur zu zweit weiter angiftet: Ich gebe NeM Recht, CS alleine kann deine Config nicht bearbeiten. Ja, der Server kann einzelne Einstellungen ändern (cl_updaterate), aber nicht dauerhaft (i.e. sie wird nicht in die Config geschrieben). Noch weniger kann ein Server das Menü bearbeiten. Auch nicht (oder eher schon gar nicht) mit serverseitigen Mods. Denn die arbeiten - wie schon gesagt - auf dem Server, nicht auf dem Client (deinem Rechner). Also musst du dafür schon irgendwas runtergeladen haben (oder runterladen lassen, beim Verbinden auf den Server z.B.)
Also würde ich sagen: Installier CS neu und such dir ordentliche Server.
Und nur weil ein Virenscanner einen Virus nicht findet, heißt das nicht, dass er nicht existiert. Viren können sich einschleusen, bevor der Virenscanner ihre Signaturen erkennt, und den Virenscanner sobald sie aktiv sind umgehen. Allerdings ist ein Virenbefall relativ unwahrscheinlich, da Viren und andere Malware vermutlich besseres zu tun haben, als deine CS-Config zu kopieren.
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Spaß beiseite, ich hab das Drecksteil mit Kaspersky aufgespürt, gekillt und dann war Ruhe. Und seitdem zahl ich 25€ im Jahr für die Vollversion. Antivir hat genau nix gefunden, obwohl ich den 2x mit einem Intensivscan über die Platte gejagt hab.