Die zwei wahrscheinlichsten Gründe die mir jetzt einfielen wäre irgendein Schädling, oder ein zerschossener Master Boot Record (MBR), bzw die Partitionstabelle. Letztere sollten sich leicht beheben lassen, indem mittels CD die Wiederherstellungs/Reparaturkonsole gestartet und der Befehl fdisk /mbr eingegeben wird.