Windows CD ins Laufwerk, neu starten, Systempartition löschen, neue Partition erstellen, formatieren, Windows installieren.

Es sei denn, du hast ne zweite Festplatte. Dann könntest du die Infizierte von da aus scannen.

Wenn Win samt Updates und Treibern fertig installiert ist, nen ordentlichen Antivirus (z.B. Kaspersky) im Hintergrund laufen lassen.