Jede Waffe hat insgesamt drei Stufen. Die Waffen, die du in Kisten einsammelst, oder einkaufst, haben alle Stufe 1. Wenn du das LCL-Cap von den Waffen erreichst (siehe Akito), dann erscheint statt einem LVL ein Stern * neben der Waffe. Anschließend brauchst du einen sog. Fluxkatalysator, den es in verschiedenen Ausführungen gibt und jede davon ist für verschiedene Items gedacht. Den setzt du dann ein, und die Waffe wird auf Stufe 2 geupgraded. Waffen können max. bis Stufe 3 geupgraded werden, d. h., wenn eine Stufe 3 Waffe ein Stern hat, kann sie nicht weiter verbessert werden.