Zu den Eidolons muss man hier anmerken, dass das nur ne THeorie ist. Es ist fast erschreckend, dass die Entwickler darauf nicht näher eingegangen sind, wenn man bedenkt, dass sie doch eine relative Wichtigkeit haben. Ganz zu schweigen davon, dass die Erklärung mit einer Gottheit, die nur in Texten der Nebenstorys erwähnt wird mir nicht sooo weniger schwammig erscheint

Will damit nicht sagen, dass Du falsch liegst, nur hätte man das ganze Götterpantheon schon deutlich besser ins Spiel integrieren können - so wirkt es eher, als wenn ihnen aufgefallen ist, dass die Story vom Spiel sehr dünn ist und sie noch schnell ein wenig was zum Spekulieren hitnergebaut haben.
Das mit Cocoon und Pule erklärt das aber wenigstens einigermaßen gut, also den gemeinsamen Hass. Fand hier besonders die Textstellen interessant, die einem erklärt haben, wieso die Leute eigentlich von Pulse geflohen sind. Nur wäre es doch deutlich schöner gewesen, dass in einer anderen Form präsentiert zu bekommen - aber da fehlen wiederum irgendwelche Interaktionsmöglichkeiten, die einem jedes andere RPG hätte einräumen können xD
Was mit der Cie'th Stelle angeht... könnte man, aber ich denke, bei der Informationslage im Spiel ists doch sehr klar, dass das nicht die Erklärung ist.