Prinzipiell geht das. Die Syntax sieht allerdings so aus:
Code: 
$game_variables[1] = []
$game_variables[1][0] = 5
$game_variables[1][1] = 8
# usw.
Nur geht der Maker davon aus das Variablen Zahlen enthalten. Sobald der Maker eine Rechenoperation (+, -, ...) oder Vergleichsoperation (<, >, <=, ...) auf eine so modifizierte Variable ausführt, kann es zum Spielabsturz kommen. Und sowas passiert schnell, wenn du irgendwo versehentlich die Variable in einer Event-Condition o.ä. stehen hast.

Davon mal abgesehen macht es absolut keinen Sinn. Warum sollte eine Variable mehrere Werte speichern. Sag mal lieber wozu du das genau brauchst. Dafür gibt es nämlich mit Sicherheit bessere Lösungen.