Öffne die Bilder nochmal mit Photoshop und indiziere sie, der Maker verlangt,
dass Grafikdateien im 8bit-Format, also mit fester Palette gespeichert sind.
Ich nehme an da du sie nachbearbeitet hast, sie auf RGB8 bzw 24bit geändert
hast um beim Editieren uneingeschränkt zu sein.

Pass aber auf was dann auf dem ersten Paletteneintrag landet, das benutzt
er dann als transparente Farbe (kannst du auch ignorieren und alle Bilder vom
Spielordner aus erneut importieren und Transparenz setzen).

EDIT: lol da war jemand knapp schneller