Der unterschied zwischen Hals und Körper ist von der Engine her so bestimmt.
Da werden selbst identische Texturen unterschiedlich dargestellt. Einen kleinen Unterschied hat man also immer.
Das andere sind die Patches. Patch 1.4 ist der letzte "Bug freie" Patch für Fallout. Wenn ich mich recht erinnere lies 1.5 keine Änderungen an Exteriors mehr zu (klappte nur noch als .esm), 1.6 ändert die Dunkelhäutigen NPC. Da waren die Selbsterstellten NPC-Neger plötzlich Weiß. 1.7 soll das ja alles wieder behoben haben, aber das glaube ich nicht.
Ich an deiner Stelle würde mal einen Bodyreplacer nutzen, vielleicht bringt der ja was.