Gut, da die Skripte clean sind, hat sich der Fall wohl erledigt und es liegt klar auf der Hand: Virenbefall durch Eigenverschulden
Virenchecker updaten und den eigenen PC überprüfen. Nur weil du in ner Datei von Projekten Viren findest, heisst das nicht, dass sie schon von vorn herein befallen sind. Viren verbreiten sich durch Ausführung einer infizierten Datei, und das Ziel dieses Virus waren wohl die zuletzt benutzten Files oder eben diese Dateitypen der Projekte.
Daher ist der Befall reiner Zufall.

Erledigt.

*clic*