Oblivion muss zuerst installiert werden, anschließend Knights of the Nine und Shivering Isles.
Anschließend solltest du aber auf alle Fälle den aktuellsten offiziellen Patch und den Inoffiziellen KotN-DLC Patch(behebt einige Probleme mit den Knights of the Nine) installieren.

Zu den Quests: Oblivion ist sehr frei was das Questen angeht: Du kannst jede Quest zu jedem Zeitpunkt anfangen und auch wieder abbrechen. Schau dich einfach um. Du wirst früher oder später auf viele der Quests stoßen.