Lies bitte nochmal deinen ersten Satz... du wirst dann feststellen, dass man nicht wirklich erkennen kann, was du sagen willst. Bemüh dich bitte, Gedankengänge klar und grammatikalisch korrekt aufzuschreiben, das ist in einem Forum besonders wichtig, weil man den Gegenüber nicht kennt und nicht weiß, ob er einen vielleicht gerade falsch verstanden hat.
Oder, um es anders zu sagen: Ich würde auf den Satz jetzt wohl antworten "Doch, die Fake-Dateien musst du löschen, wenn du keine Probleme im Spiel haben willst!!" Ich lese nämlich aus dem Satz raus, dass du - zur Sicherheit - die Fake-Dateien *nicht* löschen willst, das wäre allerdings genau das Gegenteil von dem, was du aus Sicherheitsgründen tun musst.

(Ist jetzt nicht böse gemeint, soll nur klarmachen, dass ordentlich geschriebene Posts mit richtiger Grammatik und Zeichensetzung zu sehr viel weniger Verwirrung führen.)

Zu deiner Frage:
Auch hier bin ich mir nicht ganz sicher, wie du es meinst.
Also, "Texturen-Replacer" sind einfach Download-Pakete, die nichts weiter machen als die Texturen des Spiels mit anderen zu ersetzen, also zu "replacen". Prominentes Beispiel ist Qarl's Texture Pack 3 (QTP3).
Der BSA-Entpacker ist etwas anderes - nämlich ein Programm, das BSAs entpacken kann. BSAs sind ja Archive, in denen mehrere Dateien stecken.
Oblivion benutzt mehrere BSAs als Archive. Eine heißt "Oblivion - Meshes.bsa", und wie der Name schon sagt, sind darin sämtliche Meshes des Spiels gespeichert. Eine andere heißt "Oblivion - Textures Compressed.bsa" (oder so ähnlich), darin sind wiederum sämtliche Texturen des Spiels gespeichert.

So. Im Grunde hat ein BSA-Entpacker also nichts mit Texturen zu tun. Da Texturen-Replacer aber einen der größten Modding-Bereiche darstellen, und man zum Erstellen eines Texturen-Replacers ziemlich sicher auch mal einen BSA-Entpacker benutzen muss, tauchen die Begriffe häufig zusammen in einem Artikel, einer Readme oder einem Post auf.

Vielleicht ist es noch gut zu erklären, wie Texturen-Replacer funktionieren. Achtung, das dauert lang und ist nicht unbedingt wichtig für deine Frage, liefert aber einiges an wichtigem Hintergrundwissen, um das Oblivion-Modding besser zu verstehen.

Wenn du Oblivion das erste Mal installierst und direkt danach in den Oblivion/Data/Textures Ordner gehst, wirst du feststellen (falls der Ordner überhaupt existiert), dass er leer ist - allerhöchstens noch weitere Unterordner enthält, die wiederum allerhöchstens Unterordner enthalten etc.
Das liegt daran, dass - wie oben gesagt - sämtliche Texturen in der entsprechenden BSA zu finden sind, und vom Spiel direkt auf diese BSAs zugegriffen wird.
Will man jetzt einige Texturen des Spiels durch seine eigenen ersetzen, so fügt man die Textur einfach in den Unterordner bei Oblivion/Data/Textures ein, der dem Pfad der Textur in der BSA entspricht. Wenn es in der BSA also eine Textur gibt, die den Pfad hat "textures/architecture/chorrol/textur.dds", dann musst du deine eigene textur.dds in den Ordner Oblivion/Data/Textures/Architecture/Chorrol einfügen.
Jetzt sollte eigentlich deine Textur im Spiel auftauchen - tat sie aber bei den ersten Leuten, die das so versucht haben, nicht. Grund dafür ist, dass Oblivion NICHT, wie es von den Moddern erwartet wurde, zuerst auf die "echten" Ordner zugreift, und nur wenn dort nichts ist die Texturen aus der BSA verwendet.
Wie dieses Problem gelöst wurde, hast du wahrscheinlich vom Begriff her schonmal gehört: Die Stichworte sind "Archive Invalidation", "BSA Redirection" und "BSA Alteration". Darauf gehe ich jetzt nicht näher ein, weil es nichts mit deiner Frage zu tun hat.

Wichtig ist diese Konsequenz: Wenn du irgendeine Datei in einem der Ordner unter Oblivion/Data/Textures hast, dann ist diese entweder eine Textur, die von einer Mod hinzugefügt wurde (neue Kleidung z.B. braucht ja auch neue Texturen), oder sie ist ein Replacer, sprich eine neue Textur für etwas aus dem Originalspiel. Du hast diese Textur also in jedem Fall irgendwann mal dahin entpackt - zum Beispiel, als du QTP3 installiert hast, oder als du irgendeine Mod installiert hast, von der du nicht genau wusstest was sie überhaupt macht. Ist ja auch egal, das Prinzip ist hoffentlich klar.

Da du am Anfang aber den Pfad der Textur, die du verändern willst, gar nicht kennst, brauchst du hier zumindest ein Programm, welches dir den Inhalt einer BSA anzeigen kann. Willst du im Grunde nur eine Originaltextur ein wenig verändern (zum Beispiel dunkler machen oder so etwas), dann musst du diese Textur mithilfe eines BSA-Entpackers aus der BSA entpacken, nach deinen Wünschen verändern und anschließend mit dem richtigen Pfad abspeichern.
Das ist die Verbindung zwischen BSA-Entpackern und Texturen-Replacern. Die neue Textur, die du dann erstellt hättest, wäre ein "Textur-Replacer".