Versuch mal, in dem abgesicherten Modus zu starten. Dabei wird Windows gebootet, aber nur die allernötigsten Systemkomponenten gestartet. Unter anderem wird dort die Auflösung des Monitors heruntergeschraubt und würde dir eventuell wieder erlauben, deinen Monitor als Primären Monitor zu definieren.
In den abgesicherten Modus kommst du, wenn du vor dem Bootvorgang wiederholt F8 drückst. Damit müsste ein Auswahlfenster kommen, wo du den Modus auswählen kannst. Falls nicht, probier es mit F2 oder google mal nach abgesichertem Modus (die Tastenkombination mag sich von PC zu PC unterscheiden, je nach Betriebssystem und Bios kann es Unterschiede geben).

Zu deinen Icons: Ein Rechtsklick und Symbole Anordnen nach ... hätte gereicht, um dir die Icons alle der Reihe nach auf deinem Monitor im sichtbaren Bereich anzuordnen. Diese könntest du dann wieder neu verteilen, wie es beliebt.
Zum Startmenü: Dieses wird womöglich nur auf dem primären Monitor dargestellt und auch dort geöffnet, weshalb du es nicht zu sehen bekommst. Das Problem sollte sich behoben haben, sobald dein Monitor wieder der Primäre ist.