Wenn du meinst, dass eine Formatierung sein muss. Dann mach es und schau dann, was passiert.
Das Problem kannst du höchstens umgehen, wenn du eine Linux Live CD startest und von dort aus, den Ordner kopierst.
Einige Dateien können nicht kopiert werden, da diese von Windows verwendet werden und Windows jeden Zugriff auf diese Dateien sperrt.
Nein. Da Programme etc. Daten in die Registry schreiben. Wenn du dann die C: Partition formatierst, sind auch alle Registry Daten weg. Foglich musst du die Anwendungen neu installieren.