1. Geriggte Meshes vertragen diese Prozedur (Import als .obj) nur, wenn überhaupt nichts an der Zahl der Vertices verändert wird.
Schon das Entfernen von Duplicates führt zum Chaos.
Schleierhaft ist mir, warum Du nicht als .nif exportierst. Da spielt die Vertexzahl nämlich keine Rolle, und sofern korrekt weightpainted wurde, kann man die benötigte Shape einfach in die originale .nif einkopieren (Rechtsklick > COPY BRANCH, in der originalen .nif Rechtsklick auf die oberste NiNode 0 Scene Root > PASTE BRANCH).
2. Sicher, daß Du nicht die _n.dds vergessen hast?