Beim deaktivieren einer *.omod werden alle Dateien, die beim aktivieren installiert wurden und nachher nicht durch eine andere *.omod überschrieben wurden wieder gelöscht. Ganz egal, ob diese vorher schon vorhandene Dateien überschrieben haben oder nicht.
Wenn jetzt also die Roo-OMOD Dateien von dem Fran-Addon überschrieben hat wurden die beim deaktivieren gelöscht, können also von der Fran-Addon-*.esp nicht mehr gefunden werden.


PS @Marah Da Vyr:
Solange die *.bsa mit dem Namen einer aktivierten *.esp beginnt (ohne das .esp) muss die nicht mehr in die Oblivion.ini eingetragen werden. Das beste Beispiel dafür ist vermutlich SI, dass für diesen Zweck extra eine leere *.esp bereitstellt.
Außerdem hat der zuständige *.ini-Eintrag noch das Problem, dass er nicht länger als 512 () Zeichen sein darf, sonst kommt es zu Fehlern, von denen ich aber vergessen habe, wie sie sich äußern.