Davon ist wohl auszugehen. Alle anderen Perks lassen sich immerhin auch nur auf diese Weise erlernen.

Fallout Wiki sagt dazu
Zitat Zitat
The 'Covert Ops' perk increases your level in Science, Small Guns and Lockpick by 3 points each.

Once the simulation is complete, it will appear in your Pip-Boy 3000 with the message: "You've recovered all of the hidden intel from Operation: Anchorage. Good work, soldier!"
Wenn du also nicht beim verlassen der Simulation einen solchen Perk erhältst, muss wohl von einem levelabhängigen Perk ausgegangen werden. Sonderlich gut ist dieser Bonus allerdings nicht. je 3 auf Wissenschaft, kleine Waffen und Dietriche.