Die Texturwarnungen kann man getrost wegklicken. Wenn du speicherst und es kommt eine Fehlermeldung würd ich mir die jedoch ansehen. Vor allem wenn du in einem exteroir die Navmesh geändert hast. Bei mir treten dann schon mal einige Fehler auf die erst behoben werden müssen.
Nachdem du dein Plugin das erste Mal gespeichert hast beende mal das GECK und starte es neu. Dann klick auf FILE/DATA. Dort die Fallout.esm und dein Plugin anhacken und auf SET AS ACTIVE FILE. Danach auf OK. Damit müsste dein Plugin ins GECK geladen werden. Noch ein Tipp: verwende anstatt des Launchers den Modmanager. Hoffe ich konnte helfen.