Hum. Ich habe Wubi noch nie benutz, aber es ist zuallererst schon mal eine schlechte Idee, Ubuntu auf der selben partition wie Windows zu installieren.
(Ich frage mich sowieso, wie das gehen soll. Kann aber sein, dass die Wubi entwickler da sich irgendwas ausgedacht haben...)
IdR hast du Windows auf einer NTFS Partition installiert. Das ist unter Linux sehr suboptimal - es gibt zwar (afaik auch in Ubuntu) die NTFS-3g Treiber, aber die sind nicht wirklich geignet, um Linux auf einer NTFS Partition zu installieren und zu betreiben.
Ich habe also nicht wirklich eine Idee.
Woran es eventuell liegen könnte wären schlicht und einfach die Zugrifberechtigungen. Starte mal Nautilus über sudo (Konsole, sudo nautilus, pw eingeben...) und schau nach, ob die Dateien dann vorhanden sind.
Ubuntu auf eine eigene extra Partition installieren wäre trotzdem eine gute Idee. Und es ist so einfach, da braucht man keine komischen Wubi Experimente
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