Also ich glaube Jenova ist an allem schuld.

Sie hat den Willen der Menschheit beeinflusst, dadurch kam es zu den Mako-Reaktoren und zur Ausbeutung des Planeten.
Immer mehr Menschen wurden mit ihren Zellen infiziert, also konnte sie immer mehr Menschen kontrollieren; allen voran Sephitoth, der soetwas schon bei seiner Geburt injeziert bekam.

Jenova schaffte sich Kontrolle über Shinra.
Diese erschufen Sephiroth.

Das Jenova alle kontrolliert sieht man an Cloud.
Auch das Ende -wo Cloud Seph locker mit dem Omni-Schlag besiegt- zeigt, dass der wirkliche Sephiroth auch nur so stark ist wie ein Mensch, sonst hätte Cloud ihn niemals schonmal besiegen können.

Auch der Spruch: Du bist nur eine Puppe genau wie ich, zeigt dieses.