Ich könnte mir vorstellen, dass zu diesem Zeitpunkt einfach der Treiber für den S-ATA Controller geladen wird und dieser dann krampfhaft versucht, die Festplatte zu erkennen.
Läuft die Platte überhaupt an? (Die Frage hätte man wohl schon früher stellen sollen...)
In jedem Fall würde ich's mal mit 'ner anderen Platte probieren, wenn sie selbst im BIOS nicht auffindbar ist.