Du hast vielleicht nicht alle erwischt. Kleinere Replacer (mit wenigen Dateien) löscht man am besten, indem man die Ordner des Replacers noch einmal entpackt. Danach nimmst du alle Dateien des Replacers (wirklich auf Dateienebene!) aus diesem entpackten meshes Ordner, machst sie per copy&paste in den entsprechenden Ordner unter Morrowind/Data Files/meshes/... , überschreibst damit noch mal die gleichen Dateien. Nach dieser Aktion sind diese Dateien noch ausgewählt, also einfach [Entf] klicken und weg damit. Das gleiche Spiel mit den Texturen.

Wenn das nicht klappt, sieh mal im Morrowind Ordner nach der Datei Warnings.txt und poste deren Inhalt hierher.