Ich habe es gerade einmal mit deinem Script getestet.
Wie es aussieht liegt der Fehler hier in der Klasse "Window_ShopCommand", in dieser Klasse wird nämlich tatsächlich garkeine Farbe für die Schrift eingestellt, deshalb wird die standard Farbe verwendet welche bei deinem Projekt wahrscheinlich Weiß ist.

Du hast zwei Möglichkeiten welche beide sehr simpel sind. Du veränderst die Klasse "Window_ShopCommand" und fügst einfach eine Zeile ein um die Farbe zu setzen wie in diesem Beispiel hier:
Code: 
  def initialize
    super(0, 64, 480, 64)
    self.contents = Bitmap.new(width - 32, height - 32)
    self.contents.font.color = normal_color
    @item_max = 3
    @column_max = 3
    @commands = ["Buy", "Sell", "Exit"]
    refresh
    self.index = 0
  end
Oder du änderst auch die standard Schriftfarbe in deinem Projekt auf Schwarz, das geht über folgende Zeile welche du lediglich irgendwann vor Beginn des eigentlichen Spiels, also am besten in der Main-Funktion, aufrufst:
Code: 
Font.default_color = Color.new(0,0,0,255)