1. Ja, die Suche ist nicht gerade einfach... Den vierten Spion findest du auf dem Platz direkt vor dem Shinragebäude. Dort die Treppe hoch und mit der geldgierigen Frau reden, fertig.

2. Soweit ich das überblicke macht es nichts wenn du gegen die paar Experimente von Hojo nicht kämpfst. Die Missionen sind soweit fast alle durch den Spielprozess freigeschaltet, nur einige wenige erhält man nach einem Gespräch mit einem NPC.