Kann sein, dass ich mich irre, aber wäre es nicht am einfachsten, die umliegenden Felder zusammenzurechnen? Die Summe müsste dann doch die Anzahl der lebenden Nachbarn sein, oder?

Im übrigen machst du einen Regelverstoß: Du berechnest die nächste Generation nicht parallel. cells[i][gen+1] beeinflusst die Berechnung von cells[i+1][gen], was nicht der Fall sein darf. (ich hoffe, das war verständlich)

Außerdem... sehe ich es richtig, dass du mit einem begrenzten Feld von 3*3 arbeitest? O_O

Und ich würde mit PHP ein Bild generieren (mit den image* Funktionen), aber das ist natürlich Ansichtssache. ^^