Tut mir leid, so ein Problem hatte ich noch nicht*, daher kann ich da leider auch nicht weiterhelfen. So weit ich weiß, sind solche Probleme hier auch noch nicht aufgetaucht.
(Es sind glaube ich auch nicht sehr viele Personen aus diesem Forum, die versucht aben Morroblivion zu modden.)

Du lädst also
Oblivion.esm
Morroblivion.esm
deinPI.esp (oder lädst du ohne? dann wird ja beim ersten mal speichern eine neue .esp erzeugt. Man muss einen amen eingeben und so)

Funktioniert es, wenn du ohne die Morroblivion.esm lädst? (Ja, das deutest du schon an, ich wollte nur nochmal sicher gehen.)

Kannst du Morroblivion spielen? Oder geht das auch nicht?
Hilft es vielleicht, den Konverter nochmal durchlaufen zu lassen? Die alten Dateien vorher verschieben, sie werden sonst NICHT vom Konverter überschrieben.

* Natürlich schmiert das CS manchmal ab, aber nicht immer.