Die Lösung was mein Vorgänger geschildert hat stimmt schon so.

Das Problem ist wenn du ein Filter anwendest, dann wendet man es auf eine Ebene an meistens, aber ich kenn mich mit Paint.net nicht aus ich persönlich Nutze Photoshop, da gibts auch Filter die über alle Ebene laufen...
Nun gut normalerweiße hat man mehrere Ebenen und du musst genau diese Ebene mit deinem Filter besetzen was du haben willst.

Also sagen wir mal du hast 3 Ebenen, die unterste ist die Background ebene, dann kommt dein Bild Ebene drüber und ganz oben deine Transparent-Verlauf Ebene... Dann Klickst du auf die 2Ebene mit dem Bild und gehst auf deinen bestimmten Filter und setzt diesen ein, somit sind alle anderen Ebene nicht betroffen auser die 2te.

Natrürlich darfst du dich dann nicht irretieren lassen, wenn du irgend ein Filter nutz und dein Transparent-Verlauf hat sich etwas verändert, das liegt dann an dem darunter liegenden Ebene (also deinem Bild).

Hoffe ich konnte dir Helfen soweit und habe dich auch richtig verstanden.