Nein, wenn du Ordner so verschiebst, dann bleiben alte Dateien erhalten solange nicht gleichnamige Dateien enthalten sind (die werden überschrieben - und sind in der Regel kein Problem, weil sie meistens gleiches mit gleichem überschreiben).

Hast du etwa diesen 800MB Ordner durchgeflöht und nur einzelne Dateien verschoben?