Kannst du denn eigentlich Einstellungen ändern, oder werden die beim nächsten mal zurückgesetzt? Ich meine Auflösung, Tastenbelegung, Musiklautstärke, etc.
Wenn sich die Einstellungen von einer Sitzung auf die nächste nicht zurücksetzen, dann ist deine Morrowind.ini zumindest schon mal nicht schreibgeschützt... aber das müsste man auch schon beim aktivieren von PlugIns merken.

Interessehalber: Liegt Morrowind bei dir unter Program Files oder unter Programme? Wenn unter Program Files, gibt es daneben noch einen Programme Ordner?