Also ich schließe jetzt mal von Morrowind auf Oblivion und hoffe damit nicht völlig daneben zu liegen.

Müsste es nicht reichen, einfach alle Dateien aus deinem PI-Archiv (hast du doch oder?) nochmal in den Data Files Ordner zu kopieren? Die noch vorhandenen werden überschrieben (stört ja nicht, sind ja die gleichen) und die fehlenden Dateien werden wieder eingefügt.